Namakanje je najbolj podcenjen in hkrati najpogosteje napačno uporabljen korak pri setvi. Pri nekaterih vrstah skrajša kalitev za polovico, pri drugih pa seme zaduši.
Suho seme mora pred kalitvijo sprejeti približno polovico svoje mase vode. Pri velikih semenih z debelo lupino, kot so grah, fižol in sončnica, ta postopek v zemlji traja več dni, med katerimi je seme izpostavljeno glivam. Predhodno namakanje ta čas skrajša na nekaj ur.
Uporabite mlačno vodo pri približno 25 stopinjah Celzija in posodo, v kateri je vsaj trikrat več vode kot semena. Grah in fižol namakajte osem ur, sončnico prav tako osem, mungo fižol pa osem do deset. Redkvica in zelje potrebujeta le dve uri, ajda pa dvajset minut.
Semen z drobno lupino in sluzastim ovojem nikoli ne namakajte. Lan, bazilika in kreša ob stiku z vodo ustvarijo sluz, ki jih zlepi v neuporabno gmoto. Prav tako ne namakajte amaranta in ščira, saj sta previsoka vlaga in gostota posevka pri njiju najpogostejši vzrok za propad kalčkov.
Nikoli ne podaljšujte namakanja čez noč, če ste ga načrtovali za štiri ure. Predolgo namočeno seme ostane brez kisika in začne fermentirati, kar prepoznate po kislem vonju in penastem površju. Takšno seme zavrzite, saj tudi če vzkali, bo sadika šibka.